Atom Class. 더 자세히 ...

#include <PDBatom.hh>

Public 멤버 함수
	Atom (int serial, const std::string &name, const std::string &resName, int numInRes, int resSeq, double xInit, double yInit, double zInit, double radius, double occupancy, double tempFactor, const std::string &element)
	constructor with initialization 더 자세히 ...

	~Atom ()
	Empty destructor. 더 자세히 ...

Atom *	GetNext ()
	Returns the next Atom. 더 자세히 ...

double	GetX ()
	Return the X position for the Atom. 더 자세히 ...

double	GetY ()
	Return the Y position for the Atom. 더 자세히 ...

double	GetZ ()
	Return the Z position for the Atom. 더 자세히 ...

int	GetID ()
	Return the Atom's ID. 더 자세히 ...

const std::string &	GetName ()
	Return name of the atom. 더 자세히 ...

const std::string &	GetElementName ()
	Return name of the element. 더 자세히 ...

double	GetVanDerWaalsRadius ()
	Return name of the atom. 더 자세히 ...

void	SetNext (Atom *)
	Set the next atom. 더 자세히 ...

Public 속성
int	fSerial
	its serial number 더 자세히 ...

int	fNumInRes
	its number in residue sequence 더 자세히 ...

std::string	fName
	Atom name. 더 자세히 ...

std::string	fResName
	Residue name. 더 자세히 ...

int	fResSeq
	Residue sequence number. 더 자세히 ...

double	fX
	X orthogonal coordinates in Angstroms. 더 자세히 ...

double	fY
	Y orthogonal coordinates in Angstroms. 더 자세히 ...

double	fZ
	Z orthogonal coordinates in Angstroms. 더 자세히 ...

double	fVdwRadius

double	fOccupancy
	Occupancy for the Atom. 더 자세히 ...

std::string	fElement
	Element symbol extracted from 'atom name'. 더 자세히 ...

double	fTempFactor
	Temperature factor for the Atom. 더 자세히 ...

Private 속성
Atom *	fpNext
	Pointer to the next Atom. 더 자세히 ...

상세한 설명

Atom Class.

This Class define Atom model ...

PDBatom.hh 파일의 56 번째 라인에서 정의되었습니다.

생성자 & 소멸자 문서화

Atom::Atom	(	int	serial,
		const std::string &	name,
		const std::string &	resName,
		int	numInRes,
		int	resSeq,
		double	xInit,
		double	yInit,
		double	zInit,
		double	radius,
		double	occupancy,
		double	tempFactor,
		const std::string &	element
	)

constructor with initialization

< Atom name

< Residue name

< Residue sequence number

< occupancy

PDBatom.cc 파일의 44 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : e, fElement, fName, fNumInRes, fOccupancy, fpNext, fResName, fResSeq, fSerial, fTempFactor, fVdwRadius, fX, fY, fZ, n, radius.

Atom::~Atom ( )

inline

Empty destructor.

PDBatom.hh 파일의 74 번째 라인에서 정의되었습니다.

멤버 함수 문서화

const std::string & Atom::GetElementName ( )

Return name of the element.

PDBatom.cc 파일의 109 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fElement.

int Atom::GetID ( )

Return the Atom's ID.

PDBatom.cc 파일의 95 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fSerial.

const std::string & Atom::GetName ( void )

Return name of the atom.

PDBatom.cc 파일의 102 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fName.

Atom * Atom::GetNext ( )

Returns the next Atom.

PDBatom.cc 파일의 67 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fpNext.

다음에 의해서 참조됨 : DetectorConstruction::AtomisticView(), PDBlib::ComputeMatchEdepDNA(), PDBlib::ComputeNucleotideBarycenters().

double Atom::GetVanDerWaalsRadius ( )

Return name of the atom.

PDBatom.cc 파일의 116 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fVdwRadius.

double Atom::GetX ( )

Return the X position for the Atom.

PDBatom.cc 파일의 74 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fX.

다음에 의해서 참조됨 : PDBlib::ComputeMatchEdepDNA().

double Atom::GetY ( )

Return the Y position for the Atom.

PDBatom.cc 파일의 81 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fY.

다음에 의해서 참조됨 : PDBlib::ComputeMatchEdepDNA().

double Atom::GetZ ( )

Return the Z position for the Atom.

PDBatom.cc 파일의 88 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fZ.

다음에 의해서 참조됨 : PDBlib::ComputeMatchEdepDNA().

void Atom::SetNext ( Atom * AtomNext )

Set the next atom.

PDBatom.cc 파일의 123 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음을 참조함 : fpNext.

다음에 의해서 참조됨 : PDBlib::Load().

멤버 데이타 문서화

std::string Atom::fElement

Element symbol extracted from 'atom name'.

PDBatom.hh 파일의 107 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), DetectorConstruction::AtomisticView(), PDBlib::ComputeNucleotideBarycenters(), GetElementName().

std::string Atom::fName

Atom name.

PDBatom.hh 파일의 99 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), GetName().

int Atom::fNumInRes

its number in residue sequence

PDBatom.hh 파일의 98 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), PDBlib::Load().

double Atom::fOccupancy

Occupancy for the Atom.

PDBatom.hh 파일의 106 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom().

Atom* Atom::fpNext

private

Pointer to the next Atom.

PDBatom.hh 파일의 111 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), GetNext(), SetNext().

std::string Atom::fResName

Residue name.

PDBatom.hh 파일의 100 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom().

int Atom::fResSeq

Residue sequence number.

PDBatom.hh 파일의 101 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom().

int Atom::fSerial

its serial number

PDBatom.hh 파일의 97 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), GetID().

double Atom::fTempFactor

Temperature factor for the Atom.

PDBatom.hh 파일의 108 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom().

double Atom::fVdwRadius

PDBatom.hh 파일의 105 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), GetVanDerWaalsRadius().

double Atom::fX

X orthogonal coordinates in Angstroms.

PDBatom.hh 파일의 102 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), DetectorConstruction::AtomisticView(), PDBlib::ComputeNucleotideBarycenters(), GetX().

double Atom::fY

Y orthogonal coordinates in Angstroms.

PDBatom.hh 파일의 103 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), DetectorConstruction::AtomisticView(), PDBlib::ComputeNucleotideBarycenters(), GetY().

double Atom::fZ

Z orthogonal coordinates in Angstroms.

PDBatom.hh 파일의 104 번째 라인에서 정의되었습니다.

다음에 의해서 참조됨 : Atom(), DetectorConstruction::AtomisticView(), PDBlib::ComputeNucleotideBarycenters(), GetZ().

이 클래스에 대한 문서화 페이지는 다음의 파일들로부터 생성되었습니다.:

Public 멤버 함수

Public 속성

Private 속성

상세한 설명

생성자 & 소멸자 문서화

멤버 함수 문서화

멤버 데이타 문서화